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    abcam原裝抗體WB問題超全總結詳解無信號,多條帶,高背景等難題 |靶點解惑

    更新時間:2023-05-09      點擊次數:457

    蛋白免疫印跡(WB)是利用聚丙烯酰胺凝膠電泳來檢測特定樣品或提取物中某種特定蛋白的方法。聚丙烯酰胺凝膠緊貼著膜放置,常用的膜是硝酸纖維素或PVDF(聚偏乙烯氟化物),在電流的作用下蛋白質從凝膠遷移到膜上并且被固定。膜是凝膠蛋白質的復制品,然后可以與抗體結合后進行染色。免疫印跡(WB)是一項通過凝膠電泳按照分子量大小分離蛋白,然后再利用特異性抗體識別這些蛋白的技術。它是對蛋白進行定性和相對定量的重要檢測工具。

    您在WB實驗時是否遇到無信號、高背景、多帶等問題?小編接下來將一一為您呈現這些問題的常見原因和解決方案。

    Chapter1



    無信號常見原因和解決方案


    WB實驗時出現無信號或信號弱現象,小艾歸納整理發現,主要是靶標自身特性和WB實驗流程中的樣本制備、轉膜、封閉、抗體孵育、洗膜和檢測等具體實驗細節問題會導致這一現象。接下來小艾跟大家詳細扒一扒具體細節有哪些。

    1.靶點特性導致無信號的常見原因及解決方案


    ▼ 組織或細胞中靶標蛋白含量低導致無信號或信號弱


    可通過如下建議解決:


    參考文獻或數據庫數據(例如The Human Protein Atlas)等,確認靶標蛋白是否在待檢組織或細胞中表達。我們總結了41個有表達特異性的熱門靶標表達信息,供大家參考(附錄1)。


    增加上樣量,至少上樣20-30μg蛋白。


    濃縮使信號大化(例如檢測核蛋白要用核裂解物;檢測膜蛋白用膜裂解液,超速離心分離膜蛋白)。我們總結了58個熱門靶標亞細胞定位信息,及其陽性對照供大家參考(附錄2)。


    參考文獻或產品說明書,誘導增加靶標蛋白表達。很多靶標蛋白需要藥物誘導或其它特殊處理,其含量才能達到WB檢測范圍,我們整理了17個熱門靶標蛋白在不同細胞系中藥物處理信息,及對應產品供大家參考(附錄3)。


    選擇確認表達靶標蛋白的樣本作為陽性對照(可參考產品說明書中提供的陽性對照)。


    附錄1 熱門靶標蛋白表達及陽性對照

    靶標名稱

    組織/細胞表達特異性(Uniprot)

    Alpha-synuclein

    •Alpha-synuclein主要在大腦中表達,在中樞神經系統的突觸前末梢高度表達。

    •在除肝臟外的組織中也有少量表達。

    BDNF

    •BDNF在海馬、杏仁核、大腦皮層和小腦等腦組織中高度表達。

    •BDNF也表達于心臟、肺、骨骼肌、睪丸、前列腺和胎盤中。

    Caspase-3 /cleaved Caspase-3

    •在肺、脾、心臟、肝臟和腎臟中高度表達。

    •腦和骨骼肌內中水平表達,睪丸低水平表達。

    •在許多細胞系中表達,在免疫系統細胞中的表達最高。

    ?點擊此處查看更多熱門靶標組織/細胞表達特異性


    附錄2 熱門靶標蛋白亞細胞定位及陽性對照

    靶標名稱

    蛋白亞細胞定位(Uniprot)

    陽性對照

    Alpha-synuclein

    細胞膜,細胞質,細胞核;也分泌于細胞連接、突觸和多巴胺能神經元膜結合處。

    •WB:HAP1、HEK293-T細胞裂解液 ;人、大鼠腦組織裂解液 ;重組人Alpha-synuclein蛋白(?ab51189 。

    BDNF

    分泌型

    •WB:重組人/小鼠/大鼠BDNF蛋白(?ab9794) ;人,大鼠和小鼠的腦,海馬和小腦組織裂解液

    BrdU

    細胞核

    •IHC:來自BrdU 處理的小鼠的未染色切片(?ab129956)。

     •ICC:BrdU處理的HeLa 細胞。



    附錄3 熱門靶標蛋白陽性對照及藥物處理條件


    靶標名稱

    細胞系

    試劑處理

    產品

    c-Fos

    HeLa

    血清饑餓36小時,20% FBS(2小時)

    ?ab214672

    Jurkat

    血清饑餓過夜,PMA(200 nM, 4 小時)

    RAW 264.7

    血清饑餓過夜,PMA(200 nM, 4 小時)

    Cleaved Caspase-3

    HAP1

    星形孢菌素(2 μM, 24小時)

    ?ab32042

    HeLa

    星形孢菌素(2 μM, 24小時)

    cleaved N-terminal DFNA5 / GSDME

    SH-SY5Y

    Etoposide(60 μM ,14小時)

    ?ab222408

    ?點擊此處查看更多熱門靶標蛋白陽性對照及藥物處理條件


    ▼組織或細胞中修飾后(磷酸化、乙?;头核鼗龋┑陌袠说鞍缀康?,可導致無信號或信號弱現象

    可通過如下建議解決:


    通常情況下,在未處理的組織或細胞中,大部分翻譯后修飾狀態下的蛋白含量較少。


    參考文獻或產品說明書,誘導增加靶標蛋白含量。我們整理了25個熱門靶標,在不同細胞系中檢測其翻譯后修飾形式,需藥物處理條件及對應的產品,供大家參考(附錄3)。


    裂解緩沖液中使用相應去修飾酶抑制劑。(例如靶蛋白磷酸化檢測,裂解液中需增加磷酸酶抑制劑)


    陽性對照(參考產品說明書中誘導試劑和條件,處理樣本。)


    附錄3 翻譯后修飾靶標蛋白陽性對照及藥物處理條件

    靶標名稱

    細胞系

    試劑處理

    產品

    eNOS(phospho S1177)

    HUVEC

    Pervanadate(100 uM,10分鐘)

    ?ab215717

    JAK2(phospho Y1007 + Y1008)

    Jurkat

    Pervanadate(50 mM ,5分鐘)

    ?ab32101

    C6 

    Pervanadate(50 mM,5分鐘)

    Hepa1-6

    Pervanadate(100 µM,30分鐘)

    MEF

    Pervanadate(100 µM,30分鐘)

    MLKL(phospho S345)

    L-929

    20 ng/ml TNF alpha,100 nM Smac mimetic和20 µM z-VAD(8小時)

    ?ab196436

    ?點擊此處查看更多翻譯后修飾靶標蛋白陽性對照及藥物處理條件

    注:具體細胞系處理信息請參考產品說明書


    ▼靶標蛋白是分泌型蛋白,檢測時分泌到細胞外,若檢測的樣本為全細胞裂解液,會出現無信號或信號弱現象

    可通過如下建議解決:


    使用 Brefeldin A(BFA)抑制蛋白分泌,提取全細胞裂解液。


    如果全細胞裂解液中檢測不到靶蛋白,建議提取細胞培養上清中的蛋白。




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